La producción integrada es un sistema de cultivo consistente en obtener productos agrícolas totalmente libres de residuos pero usando todas las técnicas y medios de cultivo modernos siempre sin salirse de unos estrictos reglamentos que existen para cada cultivo. En este sistema de producción los agricultores antes de realizar cualquier operación de cultivo consultan con un técnico que la Cooperativa pone a su disposición y reciben las instrucciones y recomendaciones de éste, que son fruto de multitud de datos y variables que éste analiza.

Este sistema de producción se diferencia de la agricultura convencional, en que en esta última, el agricultor toma las decisiones por si mismo sin ningún tipo de apoyo técnico y eso le lleva en muchas ocasiones a provocar no sólo un impacto ambiental sobre el medio natural, debido a la inapropiada utilización de fitosanitarios, si no a obtener productos que poseen residuos aunque estos no sobrepasen los límites establecidos por la legislación. En cuanto a la agricultura ecológica, se diferencia en que ésta está sujeta a los efectos producidos por las plagas y en muchas ocasiones si bien se obtiene una producción libre de residuos, esta tiene escasa calidad en cuanto a características organolépticas, de sabor, biológicas, aspecto, etc. En la producción integrada el técnico realiza análisis de agua de riego, suelo y foliares de las distintas parcelas y en función de esos resultados orienta sus recomendaciones al agricultor para evitar el uso abusivo de fertilizantes.

También se realiza un muestreo exhaustivo de periodicidad semanal sobre las distintas plagas que pueden afectar al cultivo y cuando los niveles poblacionales de estas superan unos determinados umbrales recomienda el tratamiento a sus agricultores, si bien recomienda la materia activa a usar, la dosis y el método que se debe emplear de manera que esta no deje residuos sobre el fruto y controlando que esta aplicación respete los plazos de seguridad. De este modo, mediante la producción integrada, se obtiene producciones agrícolas que conjugan el respeto al medio ambiente, la ausencia de residuos en las mismas y la máxima calidad. Este sistema está controlado en una estructura piramidal en la que el primer eslabón es el agricultor con sus parcelas, el segundo el técnico que supervisa la labor del agricultor y vigila plagas y carencias nutricionales que el cultivo pueda tener; así mismo, el técnico es el encargado de llevar un cuaderno de explotación para cada agricultor, en el que se anota cada una de las operaciones de cultivo realizadas por el agricultor así como los productos fitosanitarios empleados, la dosis usada y la fecha de aplicación.

El siguiente escalón lo forma la empresa auditora independiente que supervisa con periodicidad mensual la labor del técnico y verifica que se está cumpliendo el reglamento, que el cuaderno de explotación está al día y que los productos y dosis empleadas son los permitidos por el reglamento de producción integrada. Así mismo, controla la almazara durante el período de recolección para supervisar la higiene y manipulado del fruto, que las prácticas de almazara son también las recogidas en el reglamento y el aceite que se obtiene es de calidad suprema, libre de mezclas, adiciones de productos químicos y libres de residuos. Esta empresa recoge muestras al azar para realizar análisis multiresiduos tanto de aceituna como de aceite.

El último eslabón lo forma la Consejería de Agricultura y Pesca que es la encargada de vigilar y verificar tanto la función de los técnicos como de la empresa auditora independiente. Por último, es digno de resaltar que sólo se considera de producción integrada aquella aceituna directamente recogida del árbol con mantones y que no ha estado en contacto con el suelo.